游戏还增加了新的口袋普通副本关卡，3V3极限竞技带来更多的妖怪养成战术变化，为每一只精灵量身打造了唯一的精灵技能释放特效，新增了Mega巨钳螳螂，对战降低了角色30级之前升级所需经验，手游站群专用母鸡优化了聊天栏，口袋东京低价服务器并提高个体值，妖怪养成降低了融合所需要的精灵经验，雷神，对战增加了表情包，手游闪光变异后精灵外观变色，口袋炎帝，妖怪养成完美还原了宿命对决，精灵高度还原了全部六世代，对战增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的手游闪光精灵系统，Mega暴鲤龙，原始盖欧卡，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。Mega大嘴娃，增加了城内交互系统， 超过700只超强小精灵，在对战中完美表现出了属性相克，游戏中，开放了精灵闪光功能，原始固多拉，增加宠物联赛中道具掉落概率。开放了极限竞技场，游戏中，延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，并增加通用碎片，完美复刻了3DS平台的游戏体验，水君等新精灵。优化了十连抽，忠实还原十八种原作属性。野外神兽捕捉，10连抽内可能出现精灵碎片，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，联合进化等功能。